Piccolo arcipelago caratterizzato da isole e isolotti di modeste dimensioni e con habitat altamente diversificati. In esse predominano gli habitat delle scogliere e rupestri. Rappresenta l’unico sito riproduttivo della berta maggiore e della berta minore atlantica per tutto il versante adriatico d’Italia. L’area intorno agli isolotti ospita una prateria di Posidonia e su uno degli isolotti è presente una pineta autoctona a pino d’Aleppo. Questo arcipelago rappresenta un’importante rotta migratoria per numerosi uccelli. Sono presenti inoltre numerosi elementi faunistici endemici o transadriatici, tra questi si segnalano: alcune formiche endemiche del sud Italia, ristrette alle Tremiti in Puglia, la sottospecie della lucertola campestre, endemica delle Tremiti. In passato era presente la foca monaca attualmente estinta.