I Fondali dello Zingaro si estendono lungo la costa prospiciente il SIC ITA010017 e la Riserva Naturale Regionale “Zingaro”. Quest’area è in parte protetta dal regolamento della Riserva che regola l’accesso via mare e il flusso di visitatori. Nonostante il periodo estivo possa rappresentare una minaccia a causa dell’affluenza di visitatori e degli incendi che hanno interessato alcune zone terrestri, i fondali mostrano uno stato di conservazione soddisfacente. Si trovano habitat di scogliere di notevole interesse naturalistico dal sopralitorale fino al circalitorale, caratterizzati da ecosistemi a coralligeno. Inoltre, sono presenti ampie praterie di Posidonia oceanica.