Este espacio marino protegido incluye la zona de la bahía de Algeciras, y se extiende hasta el mar de Alborán. Baña el litoral del municipio de La Línea de la Concepción hasta la península de Gibraltar, en su extremo occidental. El estrecho de Gibraltar se caracteriza por ser un cañón de orientación Este-Oeste, que cuenta con aguas poco profundas en su cara atlántica y aguas más profundas en la cara mediterránea. El espacio marino protegido se encuadra dentro de estas últimas. Se han identificado varios hábitats de interés comunitario como arrecifes o cuevas marinas sumergidas o semisumergidas.